Problèmes de pratique statistiqueGénétique |
Les tortues géantes des Galapagos La fiche décrit le contenu de la liste de {Rlogo} qui reproduit les données acquises et publiées par C. Ciofi, M.C. Milinkovitch, J.P. Gibbs, A. Caccone & J.R. Powell (2002, Microsatellite analysis of genetic divergence among populations of giant Galápagos tortoises, Molecular Ecology, 11, 2265-2283). 17 populations sont réparties sur 11 localités dans 6 îles. Elles sont positionnées sur une carte schématique. Les estimations des fréquences alléliques sur 10 microsatellites hautement polymorphes donnent un beau problème de génétique spatiale. |
Acariens (Chaetodactylidae) parasites d'espèces d'abeilles (Megachilidae) Guillaume Dauphin (Master OMIV 2005) propose de visiter un bel exemple de morphométrie proposé par P. B. Klimov et B. M. Oconnor (Experimental and Applied Acarology. 33: 157-182) sur le site du North American Bee Mite project . |
Microsatellites et races bovines Un tableau important, proposé par D. Laloë, est disponible par data(microsatt). Il regroupe les fréquences alléliques pour 18 races bovines (taurines ou zébu), d'origine française ou africaine, typées sur 9 microsatellites. Pour réfléchir sur les idées de K. Moazami-Goudarzi et D. Laloë (2002, Is a multivariate consensus representation of genetic relationships among populations always meaningful? Genetics, 162, 473-484). |  |
Polymorphisme des chevaines du bassin du Rhône Un tableau de fréquences alléliques publié par B. Guinand et al. (1996) qui est disponible par data(chevaine) dans le paquet ade4. |
Les truites de J.M. Lascaux Avec data(lascaux) dans le paquet ade4, on obtient un ensemble de données acquises et traitées dans le thèse de J.-M. Lascaux (1996). Un très beau problème d'écologie statistique. |  |
Marqueurs binaires et chromosome Y Un tableau de fréquences d'haplotypes pour 25 populations d'Homo sapiens sapiens de Semino et al. 2000 (The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans: A Y Chromosome Perspective. Science, 290, 1155-9) pose d'intéressantes questions de statistique. |
Polymorphisme enzymatique d'une liliacée Fréquences alléliques croisant 13 populations et 11 loci polymorphes. Les données sont de M. Pigliucci, M. Seraphini, et G. Bianchi (1990. A study of within and amond population genetic variability in Ornithogalum montanum (Liliaceae). Canadian Journal of Botany - Revue Canadienne de Botanique 68:1788-1795). Pour une première approche des tableaux génétiques. |
